Skip to main content

Table 6 InfoGain values of different features for all PPI networks

From: Improved prediction of missing protein interactome links via anomaly detection

  Networks    
  Arabidopsis Caenorhabditis Mus Rattus   Average Standard
  thaliana elegans musculus norvegicus   deviation  
deg(u) 0.32 0.10 0.24 0.260   0.23 0.09
deg(v) 0.24 0.093 0.17 0.17   0.17 0.06
subgraph-edge-no(u) 0.23 0.07 0.19 0.20   0.17 0.07
subgraph-edge-no(v) 0.18 0.07 0.13 0.14   0.13 0.05
subgraph-edge-no[u] 0.32 0.11 0.23 0.25   0.23 0.09
subgraph-edge-no[v] 0.24 0.09 0.16 0.17   0.17 0.06
density-nbhd-subgraph(u) 0.27 0.11 0.23 0.23   0.21 0.07
density-nbhd-subgraph(v) 0.23 0.10 0.17 0.17   0.17 0.05
density-nbhd-subgraph[u] 0.28 0.11 0.23 0.23   0.21 0.07
density-nbhd-subgraph[v] 0.23 0.10 0.17 0.17   0.17 0.05
CN(u,v) 0.56 0.60 0.54 0.58   0.57 0.03
TN(u,v) 0.52 0.20 0.41 0.49   0.40 0.15
JC(u,v) 0.08 0.03 0.037 0.12   0.06 0.04
AA(u,v) 0.82 0.73 0.79 0.80   0.79 0.04
RA(u,v) 0.82 0.71 0.79 0.80   0.78 0.05
PA(u,v) 0.54 0.23 0.42 0.51   0.42 0.14
CAR(u,v) 0.08 0.06 0.11 0.09   0.08 0.02
CPA(u,v) 0.67 0.40 0.59 0.76   0.60 0.15
CAA(u,v) 0.10 0.07 0.11 0.09   0.09 0.02
CRA(u,v) 0.11 0.08 0.12 0.10   0.10 0.02
CJC(u,v) 0.08 0.06 0.10 0.09   0.08 0.02
FM(u,v) 0.82 0.58 0.69 0.66   0.69 0.10
|nbhd-subgraph(u,v) | 0.71 0.40 0.55 0.61   0.57 0.13
|nbhd-subgraph[u,v] | 0.50 0.19 0.36 0.44   0.37 0.14
|inner-subgraph(u,v) | 0.86 0.61 0.72 0.71   0.72 0.10
  1. All features with average deviation (or average mean) > 0.5 for all networks are in bold. All values > 0.5 are in bold