Applied Network Science

Table 6 InfoGain values of different features for all PPI networks

From: Improved prediction of missing protein interactome links via anomaly detection

	Networks
	Arabidopsis	Caenorhabditis	Mus	Rattus		Average	Standard
	thaliana	elegans	musculus	norvegicus		deviation
deg(u)	0.32	0.10	0.24	0.260		0.23	0.09
deg(v)	0.24	0.093	0.17	0.17		0.17	0.06
subgraph-edge-no(u)	0.23	0.07	0.19	0.20		0.17	0.07
subgraph-edge-no(v)	0.18	0.07	0.13	0.14		0.13	0.05
subgraph-edge-no[u]	0.32	0.11	0.23	0.25		0.23	0.09
subgraph-edge-no[v]	0.24	0.09	0.16	0.17		0.17	0.06
density-nbhd-subgraph(u)	0.27	0.11	0.23	0.23		0.21	0.07
density-nbhd-subgraph(v)	0.23	0.10	0.17	0.17		0.17	0.05
density-nbhd-subgraph[u]	0.28	0.11	0.23	0.23		0.21	0.07
density-nbhd-subgraph[v]	0.23	0.10	0.17	0.17		0.17	0.05
CN(u,v)	0.56	0.60	0.54	0.58		0.57	0.03
TN(u,v)	0.52	0.20	0.41	0.49		0.40	0.15
JC(u,v)	0.08	0.03	0.037	0.12		0.06	0.04
AA(u,v)	0.82	0.73	0.79	0.80		0.79	0.04
RA(u,v)	0.82	0.71	0.79	0.80		0.78	0.05
PA(u,v)	0.54	0.23	0.42	0.51		0.42	0.14
CAR(u,v)	0.08	0.06	0.11	0.09		0.08	0.02
CPA(u,v)	0.67	0.40	0.59	0.76		0.60	0.15
CAA(u,v)	0.10	0.07	0.11	0.09		0.09	0.02
CRA(u,v)	0.11	0.08	0.12	0.10		0.10	0.02
CJC(u,v)	0.08	0.06	0.10	0.09		0.08	0.02
FM(u,v)	0.82	0.58	0.69	0.66		0.69	0.10
\|nbhd-subgraph(u,v) \|	0.71	0.40	0.55	0.61		0.57	0.13
\|nbhd-subgraph[u,v] \|	0.50	0.19	0.36	0.44		0.37	0.14
\|inner-subgraph(u,v) \|	0.86	0.61	0.72	0.71		0.72	0.10

All features with average deviation (or average mean) > 0.5 for all networks are in bold. All values > 0.5 are in bold

Back to article page